将整合我们的资源及专业技术

灵宝新闻网 丁艳 2020-03-04 08:26:30
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  如国家超级计算深圳中心主任冯圣中所言:“科学阻击疫情的每一个环节,都需要超算来支持。”

  三月三日,英特尔、联想及华大基因宣告正携手加快COVID-一九新型冠状病毒的基因组特性分析。通过这项合作,华大基因将患上以继续优化其新型冠状病毒检测试剂盒并获患上大量有价值的信息,有助于肯定开发有效疫苗或者治疗法子的潜伏靶标。

  联想团体高档副总裁、企业科技团体总裁童夫尧说:“来自英特尔及联想的大数据分析以及健康与生命科学方面的专家,将整合咱们的资源及专业技术,匡助解决目前面临的严峻挑战,推进健康以及生命科学的发展过程。”

  在英特尔以及联想为华大基因提供的包孕硬件、软件、交付及服务的端到端解决方案中,大型高机能计算(HPC)集群用于处理从华大DNBSEQ-T七 测序系统读取的高通量数据,支撑科学家钻研病毒的毒性、传布模式、病原体与宿主间的互相作用,进而助力流行病学及疫苗设计钻研。这些工作对于未来创立更好的诊断法子以及设计有效的疫苗或者其他维护性措施(例如免疫疗法)相当首要。

  在软件方面,通过英特尔以及联想的共同努力,联想超算技术支撑并优化的“基因组优化以及可扩张性工具”(GOAST,首个获取英特尔精选解决方案验证的基因组分析工具),可为全基因组测序以及全外显子测序的计算提供高达四0倍的加速,匡助华大基因更快生成可靠的基因组分析成果,缩短科研以及临床察看的时间。

  英特尔公司市场营销团体副总裁兼中国区总经理王锐说:“华大基因通过分析病毒基因组数据,加速对于传染者的快速辨认以及基因组特性的钻研需要投入巨大的计算资源,这恰正是咱们可以施展作用的处所。”

  在基因测序工作中,每一毫升体液通常囊括数百万个不同的病毒体,而每一个病毒体的基因组则囊括大约三0,000个DNA碱基或者字母。华大基因目前对于传染患者以及疑似传染患者的微生物基因测序钻研工作将生成TB级甚至PB级的海量数据。

  “华大基因已经对于数百份临床样本进行了测序,以分析以及区外传染的并发症。”华大基因首席信息官晋向前说,“基因组比对于、基因组组装、基因组注释以及病毒核酸片断的系统分析,是1个高密度的计算进程,使用最新的高机能计算以及基因组分析技术是提高分析效率的首要手腕。这些设备以及技术将加快对于新型冠状病毒传染者的快速辨认以及病毒基因组特性的钻研,为新型冠状病毒的精准诊断、治疗以及疫情防控提供强有力的支撑。”


(责编:赵超、毕磊)

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